鱼蛋白肥料含有机质。鱼蛋白、杜肽和生物多糖在土壤中的应用，可以大大加强土壤有机质的含量，利于土壤微生物的繁殖速度，增加土壤的活性。它能活化土壤养分，增加土壤肥力，改变土壤肥力，增加土壤肥力和保水能力，改变长期使用化肥造成的土壤硬化，保持土壤肥力恒定。

　　鱼蛋白肥料也是一种功能性肥料。可作基肥、追肥、灌溉根系、滴灌和叶面喷施。

　　施用鱼卵清肥能利于根系发达，增加光合作用，利于植物生长和花芽分化和早熟，品质会大大增加。果树喷施，叶绿鲜艳，病害减少，花果减少，果形好，甜度高，瓜菜品质好，产值高，营养比较丰富，口感好，色泽鲜艳，是一种无公害的绿色营养肥料。

　　此外，对某些病虫害也有较好的防治作用。可以说，鱼蛋白肥料可以较广的应用于以下几个方面：培育壮苗、用鱼蛋白肥激发植物潜力、硬实苗、黄苗、无根鱼蛋白肥、农药伤害、冻害、高温鱼蛋白肥、少落花果，鱼蛋白肥用于花果保鲜、果实膨大、色泽特殊、增甜、腥味改变口感的蛋白质肥料。

　　在三叶一心期、多样性期、灌浆早中期喷施一次鱼蛋白叶面肥，可使水稻植株结实、绿色，穗长低，空枯率低，千粒重低。当水稻的叶子成熟时，它们会提早成熟。棉花萌芽期、结铃期和采摘前叶面喷施鱼蛋白肥对棉花生长有较好的作用，主要表现在增加棉株、增加单株铃数、增加单铃重和增加产值。在病毒病早期，应用鱼蛋白叶面肥配合杀毒农药，可减轻病毒病引起的叶片萎缩、条纹、花、叶等症状。