从成本上看，氨基酸液肥的成本较低，其次是多肽和鱼蛋白肥料；从组成上看，鱼蛋白较复杂，多肽次之，氨基酸较简单；从功能上看，鱼蛋白和多肽的功能和效果比氨基酸，当然，不同产品的含量和生产工艺是不同的，应该根据实际情况来判断

　　如果是为了提高肥料利用率，加速养分吸收，补充微量元素，建议使用氨基酸肥料。这种产品的成本很低。能有效提高无机肥利用率，缓解土壤酸碱变化。

　　为了提高作物的抗逆性，抵抗恶劣环境（低温、干旱、洪涝、药害等）的危害，建议使用多肽和鱼蛋白肥料。特别是鱼蛋白能提高作物的抗低温能力。原因是鱼类蛋白质中不仅含有多种氨基酸，还含有一些不饱和脂肪酸。这些不饱和脂肪酸被植物吸收后，可以保持细胞膜的流动性，保持细胞膜的完整性，降低植物体内水分的冰点。氨基酸和肽不具备这种功能。此外，鱼蛋白还含有维生素、磷脂、微量元素等营养成分，这些营养成分也比氨基酸溶液好。

　　对于优良多肽和鱼蛋白肥料，为了节约成本和提高肥料吸收率，尽量喷在叶子上，而对于氨基酸肥料，尽量喷在两边。由于多肽和鱼蛋白肥的分子量较大，需要通过气孔吸收大部分营养物质。喷施多肽或鱼蛋白肥时，尽量均匀地喷在叶片的前部和后部（植物叶片后部的气孔数大于前部），这样可以提高这些肥料的吸收利用率，取得较好的效果。另外，多肽、鱼蛋白、硫酸铜和碱性硫酸铜的混合物会导致蛋白质变性和沉淀，严重影响使用效果，使用时应特别注意。